Soluții informatice de analiză date genomice și gestiune resurse

SEAP

DA36960565

Data

19 Noiembrie 2024

Valoare

263.885 RON

Stare

Oferta acceptata

Autoritatea contractanta

47687238 - Institutul de Cercetare-Dezvoltare în Genomică

Localitate

Bucuresti, Bucuresti

Furnizor

16728583 - S.C. Omnivet Impex S.R.L. S.R.L.

Tipul contractului

Furnizare

Cod CPV

48900000-7 - Diverse pachete software si sisteme informatice (Rev.2)

Descriere:

Specificații tehnice minimale: Suită de aplicații compusă din una sau mai multe componente pentru analiză date genomice, cu următoarele funcții: Analiza secundara completa de exom si genom: Capabilități de analiză pentru secvențierea completa a genomului și a exomului folosind citiri scurte; incluzand detecția variațiilor genomice precum SNP, InDel și CNV. Analiza de Variații Structurale: Posibilitatea de a identifica variații structurale complexe (de exemplu, inversii, translocații). Adnotare a variantilor: Instrumente pentru adnotarea variantelor identificate utilizând algoritmi specifici sau baze de date de referință (e.g., VEP, SnpEff, dbSNP, ClinVar). Standarde de calitate: Un grad inalt de acuratete pentru variantele genomice scurte detectate (SNP,MNP,indel), dovedibil prin analize de referinta (i.e., tip ‘benchmark’) pe seturi de date publice sau proprietare. Standarde de raportare: Raportarea pasilor intermediari reprezentativi (aliniere, varianti), si raportarea scorurilor de calitate relevante pentru variatiunile finale (e.g., variant quality score, genotype quality score, depth of coverage per variant, etc.) Vizualizare și Interpretare: Instrumente de vizualizare a variantelor raportate, prin statistici dar si care permit examinarea detaliată a secvențelor, aliniamentelor si valorilor de calitate, pentru diversele variante detectate. Se vor respecta toate cerintele din Documentatia nr.309/ 18.11.2024, atasata

Achizitii

263.885 RON

Cantitate: 1

Unitate masura: bucata

Set solutii informatice de analiza date genomice si gestiune resurse

CLC Genomics WB Premium Network Licenta network, 1 an Soft ce permite obtinerea de varianti din seventierea intregului genom SNP, indel si SV si permite filtrarea lor pe baza de calitate pentru a obtin Pachet software care permite analiza datelor de secventa ADN, ARN si proteine, analiza nivelului de expresie genica, design-ul de primeri, proiectarea experimentelor de clonare, analiza filogenetica si a datelor obtinute prin secventiere Soft ce dispune de baza de date de referinta pentru genomul uman (facilitare proces de asamblare a secventelor obtinute); permite proces de asamblare de novo; detectia de SNP si DIP; asigura suport pentru asamblarea de secvente din date mixte (pool); permite analiza secventelor de ARN; generarea de profile de expresie genica; permite analize de tip ChIP-Seq e un set de inalta calitate Acces 2 utilizatori concomitent Acces Emedgene interpretare echivalentul a 100 genomuri Soft adnotare tertiara a datelor obtinute prin secventiere de noua generatie la nivel de WGS si WES si de indentificarea variantelor genetice Analiza genomică completă: Capacități avansate pentru analiza completă a exomului și a genomului, inclusiv detectarea variațiilor genomice (SNP, InDel, CNV) și a variațiilor structurale complexe (inversii, translocații). Adnotare precisă a variantelor: Integrare cu baze de date de referință și utilizarea algoritmilor consacrați pentru adnotarea variantelor identificate. Standard de calitate ridicat: Detectare de înaltă acuratețe pentru variațiile genomice, dovedită prin benchmark-uri pe seturi de date publice sau private. Raportare detaliată: Generarea de rapoarte standardizate care includ detalii intermediare și scoruri de calitate pentru variații. Vizualizare și interpretare: Instrumente intuitive pentru vizualizarea variantelor, examinarea secvențelor și evaluarea parametrilor de calitate. Compatibilitate multiplatformă: Disponibil pe Windows și Linux, cu opțiuni pentru instalare locală sau în cloud. Interfață prietenoasă și utilizator-centrică: Acces facil la funcționalitățile de analiză, reducând curba de învățare pentru utilizatori. Scalabilitate și performanță: Suport pentru procesarea rapidă a datelor mari, inclusiv compatibilitate cu sisteme HPC. Securitate și conformitate GDPR: Trasabilitate a analizelor și management sigur al datelor sensibile. Licențiere flexibilă: Adaptabilă la nevoile instituției, incluzând utilizatori concurenți. Actualizări și suport tehnic incluse: Asistență pe o perioadă de 12 luni, documentație completă, sesiuni de instruire și tutoriale pentru utilizatori. Servicii incluse: Instalare, punere în funcțiune, documentație tehnică, și suport pentru actualizări pe durata licenței.